FusionCatcher从患病样本中搜索RNA-seq数据（来自Illumina NGS平台（如Solexa和HiSeq）的成对末端读数）中的新颖/已知的体细胞融合基因，易位和嵌合体。 FusionCatcher的目标是：-发现候选融合基因的检测率非常高，-非常易于使用（即，无需具备数据库和生物信息学的先验知识即可运行FusionCatcher），-非常有挑战性的融合基因的很好检测，例如IGH融合，CIC融合，DUX4融合，CRLF2融合，TCF3融合等）-尽可能自动进行（例如，FusionCatcher将自动选择最佳参数以找到候选融合基因，例如自动寻找衔接子，根据输入读段的长度等自动建立外显子-外显子连接），同时为发现融合基因提供最佳的检测率。
