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covidtracker:COVID追踪器
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2021-03-13
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COVID追踪器CA 的构建集中在加州,使用公共全球共享禽流感数据倡议组织序列。 包含: 所有CA序列 BLAST中来自世界其他地区的最接近CA的序列 使用标准子采样从世界其他地方选择上下文 然后将最后一棵树修剪成仅CA序列,它们的直接祖先以及具有与直接祖先相同的基因组的上下文序列。 这旨在增强可见性,并专注于CA的介绍和动态。
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covidtracker-master
.gitattributes 65B
auspice
covidtracker_ca.json 133B
covidtracker_czb.json 14.26MB
covidtracker_pawnee-examples.json 858KB
narratives
infection_tree_alignment.png 303KB
pawnee.jpg 135KB
infection_tree.png 726KB
covidtracker_pawnee-interpretation-examples.md 21KB
LICENSE 1KB
README.md 525B
lineage_counts
lineage_line_list.csv 422KB
lineage_counts.csv 57KB
fetch-format-lineage-counts.ipynb 8KB
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刘岩Lyle
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