Arron-IMSA:下一代数据集的综合元基因组序列分析-开源

我们提出了集成元基因组序列分析（IMSA），这是一种灵活，快速且强大的计算分析管道，可供公众使用。 IMSA从高吞吐量数据集中获取输入序列，并使用用户定义的主机数据库过滤掉主机序列。 然后，IMSA将过滤后的读段与用户定义的通用数据库对齐，以表征主机背景中的外源读段。 IMSA根据读取频率为分类的每个节点分配一个分数，并可以将其作为适合于聚类分析的分类报告或分类地图（TaxMap）输出。 IMSA还输出分配给目标分类单元的特定序列读数，以进行下游分析。