没有合适的资源?快使用搜索试试~ 我知道了~
Next_Gen_Sequencing_Project
共162个文件
html:85个
png:62个
rmd:4个
需积分: 9 0 下载量 150 浏览量
2021-04-18
09:54:41
上传
评论
收藏 25.53MB ZIP 举报
温馨提示
NGS RNA-Seq项目 进度报告:完成对齐并生成读取计数 报告:杰克·索特( Jake Sauter) 日期:3/19/2021 背景 可以在找到本研究中使用的fastq文件以及 出版物: 亚利桑那州衰老和神经退行性疾病/脑与身体捐赠计划的研究已对所有受试者进行了临床和神经病理学表征(Beach等,2015)。 所有AD受试者均在临床上被诊断出患有AD,并且经神经病理学证实大脑具有“频繁的” CERAD神经斑密度(Mirra等,1991)和Braak评分V或VI(Braakand Braak,1991)。 对照组在生活中没有痴呆症,AD或其他神经系统疾病的诊断。 下载髓样/小胶质细胞数据 对于第一次迭代,我选择继续使用四种可用细胞类型中的一种,即髓样/小胶质细胞。 但是,可以通过简单的for循环轻松地将以下脚本修改为下载所有cell_types 。 # I got a 2TB S
资源推荐
资源详情
资源评论
收起资源包目录
Next_Gen_Sequencing_Project (162个子文件)
.gitignore 52B
final_project_report.html 3.76MB
index.html 3.76MB
final_project_report.html 3.46MB
finish_aligning.html 1.52MB
multiqc_report_1.html 1.37MB
multiqc_report.html 1.37MB
processing_project_data.html 1.36MB
trimmed_myeloid_multiqc_report.html 1.36MB
non_trimmed_multiqc_report.html 1.22MB
multiqc_report.html 1.22MB
notes_for_writing_final_report.html 858KB
SRR8440539_trimmed_fastqc.html 605KB
SRR8440539_trimmed_fastqc.html 605KB
SRR8440542_trimmed_fastqc.html 600KB
SRR8440538_trimmed_fastqc.html 598KB
SRR8440538_trimmed_fastqc.html 598KB
SRR8440524_trimmed_fastqc.html 594KB
SRR8440524_trimmed_fastqc.html 594KB
SRR8440525_trimmed_fastqc.html 594KB
SRR8440536_trimmed_fastqc.html 594KB
SRR8440482_trimmed_fastqc.html 592KB
SRR8440482_trimmed_fastqc.html 592KB
SRR8440486_trimmed_fastqc.html 592KB
SRR8440517_trimmed_fastqc.html 591KB
SRR8440531_trimmed_fastqc.html 590KB
SRR8440529_trimmed_fastqc.html 590KB
SRR8440513_trimmed_fastqc.html 589KB
SRR8440449_trimmed_fastqc.html 589KB
SRR8440443_trimmed_fastqc.html 589KB
SRR8440443_trimmed_fastqc.html 589KB
SRR8440448_trimmed_fastqc.html 589KB
SRR8440448_trimmed_fastqc.html 589KB
SRR8440514_trimmed_fastqc.html 588KB
SRR8440514_trimmed_fastqc.html 588KB
SRR8440463_trimmed_fastqc.html 587KB
SRR8440463_trimmed_fastqc.html 587KB
SRR8440527_trimmed_fastqc.html 587KB
SRR8440477_trimmed_fastqc.html 586KB
SRR8440477_trimmed_fastqc.html 586KB
SRR8440488_trimmed_fastqc.html 586KB
SRR8440518_trimmed_fastqc.html 585KB
SRR8440518_trimmed_fastqc.html 585KB
SRR8440447_trimmed_fastqc.html 584KB
SRR8440501_trimmed_fastqc.html 584KB
SRR8440501_trimmed_fastqc.html 584KB
SRR8440484_trimmed_fastqc.html 584KB
SRR8440511_trimmed_fastqc.html 582KB
SRR8440511_trimmed_fastqc.html 582KB
SRR8440536_fastqc.html 574KB
SRR8440539_fastqc.html 569KB
SRR8440539_fastqc.html 569KB
SRR8440538_fastqc.html 564KB
SRR8440538_fastqc.html 564KB
SRR8440542_fastqc.html 563KB
SRR8440524_fastqc.html 558KB
SRR8440524_fastqc.html 558KB
SRR8440525_fastqc.html 558KB
SRR8440529_fastqc.html 558KB
SRR8440463_fastqc.html 556KB
SRR8440463_fastqc.html 556KB
SRR8440513_fastqc.html 555KB
SRR8440486_fastqc.html 555KB
SRR8440448_fastqc.html 555KB
SRR8440448_fastqc.html 555KB
SRR8440531_fastqc.html 554KB
SRR8440449_fastqc.html 554KB
SRR8440443_fastqc.html 554KB
SRR8440443_fastqc.html 554KB
SRR8440517_fastqc.html 552KB
SRR8440514_fastqc.html 552KB
SRR8440514_fastqc.html 552KB
SRR8440482_fastqc.html 552KB
SRR8440482_fastqc.html 552KB
SRR8440527_fastqc.html 551KB
SRR8440484_fastqc.html 550KB
SRR8440518_fastqc.html 550KB
SRR8440518_fastqc.html 550KB
SRR8440501_fastqc.html 549KB
SRR8440501_fastqc.html 549KB
SRR8440477_fastqc.html 549KB
SRR8440477_fastqc.html 549KB
SRR8440511_fastqc.html 548KB
SRR8440511_fastqc.html 548KB
SRR8440447_fastqc.html 547KB
SRR8440488_fastqc.html 546KB
processing_project_data.md 33KB
finish_aligning.md 26KB
README.md 23KB
cooksDist.pdf 132KB
graph_plot.png 252KB
paste-4FC88795.png 158KB
per_seq_gc_content.png 122KB
samtools_coverage_example.png 117KB
per_base_seq_content_fail.png 112KB
paste-BBC9C395.png 97KB
paste-F5E662DB.png 85KB
paste-E644752B.png 77KB
unnamed-chunk-19-1.png 73KB
paste-13B57224.png 69KB
共 162 条
- 1
- 2
资源评论
越昆
- 粉丝: 21
- 资源: 4598
上传资源 快速赚钱
- 我的内容管理 展开
- 我的资源 快来上传第一个资源
- 我的收益 登录查看自己的收益
- 我的积分 登录查看自己的积分
- 我的C币 登录后查看C币余额
- 我的收藏
- 我的下载
- 下载帮助
安全验证
文档复制为VIP权益,开通VIP直接复制
信息提交成功