covid-reinfection:“在美国血清流行病学工作场所队列中SARS-CoV-2感染和再感染的代码”

共感染 该存储库包含数据和代码，以产生“美国SARS-CoV-2流行病学工作场所队列中的SARS-CoV-2感染和再感染”中介绍的数据和模拟分析。 两者都使用的数据位于文件夹data 。 由于此分析使用的是个人级别的数据，因此为了保护参与者的机密性和匿名性，我们没有包括完整的数据集。 该存储库包括聚合的PCR和血清学数据，以及一个包含未经调整和调整后的比值比估计值的文件，该估计值是通过对整个数据集进行逻辑回归得到的再感染的。 存储库中包含以下脚本： - odds-ratio-estimates-main-figure.R主图odds-ratio-estimates-main-figure.R再现显示调整后的比值比移动阈值分析的主要图形。 appendix-simulation-analysis.R再现附录中显示的仿真分析（图3）。 - appendix-odds-ratio-co