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parallelblast_plus:数据库切片 Blast 实现-开源
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2021-05-31
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程序的更新版本:Parallel BLAST on split databases" Bioinformatics 2003 Sep 22;19(14):1865-6. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btg250 但现在可与现代 BLAST 版本一起使用。
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parallelblast_plus-1.0.3.tar.gz (41个子文件)
parallelblast_plus
pvmblastslave_rev2.sh 5KB
README.TXT 11KB
mailparallelblastresults.pl 10KB
genericfailurehtml.pl 1KB
pvmsplitdbslave.pl 7KB
fastaproperties.c 10KB
fastafrag.c 15KB
pvmsplitcddslave.pl 5KB
HOW_TO_DO_CDD.TXT 6KB
pvmsplitdbmaster.pl 12KB
cdd.ncbirc 79B
parallel_dblist.txt 8KB
fetch_db_bac.pl 13KB
blastcontrol_rev2.pl 110KB
fix_oid_bac.pl 8KB
fetchtaxon.sh 2KB
blastcontrol_rev3.pl 123KB
pvmsplitoidslave.pl 8KB
lookup_org_chr_position.html 51KB
secondary.txt 1KB
fetch_db.sh 4KB
HOW_TO_DO_CORE_DATABASES.TXT 6KB
machines.LINUX_INTEL64 469B
from_secondary 2KB
split_cdd.sh 1KB
HOW_TO_DO_SECONDARY_STORAGE.TXT 2KB
oid_db.sh 3KB
mailparallelblastresults.sh 450B
pvmblastmaster_rev2.pl 34KB
blastplusmerge.c 61KB
setuser.c 3KB
pvmsplitcddmaster.pl 11KB
fetch_db_bdb.sh 4KB
prep_taxon_oidl.c 24KB
fastarange.c 7KB
secondary_storage 3KB
pvmsplitoidmaster.pl 9KB
final.patch 15KB
fetch_cdd.sh 1KB
COPYING 34KB
split_db.sh 4KB
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