MQuad:线粒体异质性建模工具

四方 MQuad：用于单细胞组学数据中线粒体突变检测的混合物模型 MQuad是检测线粒体突变的工具，可为克隆亚结构的推断提供信息。 它使用二项式混合模型评估背景噪声中mtDNA变异体的异质性。 推荐的用于生成必要文件的管道： 使用或 （ 的较快版本，仍处于测试阶段，因此可能不稳定）从原始.bam文件中堆积mtDNA变体 使用MQuad区分信息丰富的mtDNA变异体与嘈杂的背景 使用基于mtDNA变异谱将细胞分配给克隆 如果可以使用必要的文件格式，则也可以使用不同的上游/下游软件包。 安装 MQuad可通过。 要安装，请键入以下命令行并添加-U进行更新： pip install -U mquad 或者，您可以通过以下命令行从该GitHub存储库中安装最新版本（通常是开发版本）： pip install -U git+https://github.com/single-cell-ge