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PDECIF
共9个文件
gitignore:4个
py:2个
csv:1个
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2021-03-21
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论文代码:对绑定亲和力预测的扩展连接交互功能的简单空间扩展 有两个文件夹(a) data_generation和(b) benchmarking 。使用(a),可以从基本mol和mol2文件生成我们的实验中使用的数据集。要生成实验中使用的ECIF和PDECIF数据集,应从https://drive.google.com/file/d/1B7bUGcVTU-wBCSMs6TdPfF9o1WC_nhia/view?usp=sharing下载并提取到data_generation\input\文件夹。本文中讨论的每年应该有三个文件夹。在data_generation\src\运行文件应生成数据集并将其放置在data_generation\output\文件夹中。注:我们下载的PDB_Atom_Keys.csv从原始ECIF纸使用的文件: https://github.com/DIFACQUIM/
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PDECIF-main.zip (9个子文件)
PDECIF-main
data_generation
input
PDB_Atom_Keys.csv 3KB
output
.gitignore 0B
src
spatial_ecif.py 7KB
ecif.py 7KB
benchmarking
output
models
.gitignore 0B
bootstrap_performance
.gitignore 0B
general_performance
.gitignore 0B
code
benchmarks.R 4KB
README.md 1KB
共 9 条
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