bisulfite

聚类 这是一个可选步骤。 如果数据集包含具有不同亚硫酸氢盐可及斑块的序列，则使用“ clustering.py”将整个数据集分为多个组。 在示例文件夹中，“ dsid_C_1461.csv”是需要聚类的数据集。 它的第一列是每个序列的ID，最后一列是每个序列的频率。 “ clustering.py”需要两个参数。 在第1行中，输入文件的路径和名称：〜/ dsid_C_1461.csv 在第2行中，输入集群号。 它为同一文件夹中的群集输出多个csv文件。 贝叶斯分割 “ bayesian_segment.py”用于检测亚硫酸氢盐可及区域。 在示例文件夹中，“ dsid_C_1461_0.csv”是“ clustering.py”输出的群集之一。 “ bayesian_segment.py”仅需要一个参数，即第1行中数据集的路径和名称：〜/ dsid_C_1461_0.csv