PANDA:在网络之间传递属性以进行数据同化-开源

PANDA (Passing Attributes between Networks for Data Assimilation)，是一种用于基因调控网络重建的消息传递模型。 PANDA 整合了多种生物数据来源，包括蛋白质-蛋白质相互作用、基因表达和序列基序信息，以重建全基因组、特定条件的调控网络。 PANDA 还提供其他编程语言，包括： MATLAB/Octave：(1) https://drive.google.com/a/channing.harvard.edu/file/d/0BwVdzX3nIj6RamtmNVdKYVk1N2c/view?usp=sharing (2) https://github.com/QuackenbushLab/matlab-panda Python：（1）https://github.com/davidvi/pypanda（2）https://github.com/QuackenbushLab/pypanda Bioconductor/R：http:// /www.bioconductor.org/packages/devel/bioc/html/