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type-variants-nf:使用ncov2019-artic-nf管道的输出来检测SARS-CoV-2变体
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2021-02-13
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类型变量nf 概括 该管道用于运行connor-lab / ncov2019-artic-nf的“ typing”部分,以检测SARS-CoV-2“相关变量”。 用法 nextflow run main.nf \ --variants_dir </path> \ --ref </path> \ --gff </path> \ --yaml </path> \ --outdir <output> \ --prefix <output> 示例输出 输出目录结构: <prefix>.typing_summary.csv <prefix>.variant
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易洪艳
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