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KNIME-ProteinLasso:用于蛋白质推理的ProteinLasso算法的KNIME节点
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2021-05-10
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尼米蛋白套索 关于KNIME-ProteinLassoInference节点 ProteinLassoInference是一个KNIME节点实现,用于对质谱数据进行蛋白推断分析。 ProteinLasso模型将蛋白质推断问题公式化为受约束的Lasso回归问题。 执照 knime-protein_lasso是根据许可的JOmics。 引用方式: ProteinLasso:shot弹枪蛋白质组学中蛋白质推断问题的Lasso回归方法。 Comput Biol Chem。 2013年4月; 43:46-54。 黄T,龚H,杨C,何Z. ( ) 主要特点 快速高效地处理大型数据集(表格格式,如输入)。 结构简单(一个端口输入/一个端口输出)。 需要肽的后验错误概率(PEP)和肽的可检测性(如输入参数)。 计算蛋白质的后验误差概率。 与OpenMS工作流程轻松集成的可能性。 节点输入/
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KNIME-ProteinLasso-master.zip (15个子文件)
KNIME-ProteinLasso-master
META-INF
MANIFEST.MF 654B
src
uni
tubingen
inference
proteinlasso
ProteinLassoNodeDialog.java 3KB
ProteinLassoNodePlugin.java 2KB
default.png 1KB
package.html 811B
ProteinLasso.java 17KB
ProteinLassoNodeView.java 1023B
ProteinLassoNodeFactory.java 1KB
ProteinLassoNodeModel.java 8KB
ProteinLassoNodeFactory.xml 2KB
build.properties 148B
.gitignore 93B
plugin.xml 735B
lib
weka.jar 4.02MB
README.md 3KB
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张A裕
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