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bgmc:Brownian Gas蒙特卡洛
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Brownian Gas蒙特卡洛 与该资料库相关的手稿正在建设中。 需要完成的任务 待办事项TT: TODO:生成网格搜索参数文件 TODO:使仿真作为命令行可执行文件运行 TODO:测试计算集群 TODO:网格搜索计算集群 待办事项:dev logdown.sh / logdown.py汇总结果 待办事项:可视化结果/适合WJ的结果 待办事项: 待办事项:更新lib / return_CollTime_test.m以计算预期的CollTime和引导程序delta_CollTime(请参阅第161-162行) 待办事项:将笔记上传到下页并与TT分享
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bgmc:Brownian Gas蒙特卡洛 (107个子文件)
return_CollTimes.c 4KB
matrix_lst.c 1KB
return_pi.c 775B
random_broken.c 540B
print.c 337B
srand.cpp 270B
out.csv 8KB
run_1.dat 170KB
run_test.dat 19B
run_test.dat 10B
.gitignore 920B
.gitignore 165B
pbc.h 1KB
random.h 783B
CommonDefines.h 336B
rrate.h 242B
test.input 25B
params.input 7B
return_pi.input 5B
fitting monte carlo results to birth death rates from the full simulation.ipynb 266KB
estimating uncertainty in mean death rate.ipynb 149KB
analyzing dense output for one trial condition.ipynb 125KB
analyzing dense output for one trial condition-checkpoint.ipynb 125KB
analyzing dense output from distributed grid search.ipynb 40KB
merging dense output from distributed grid search.ipynb 8KB
analyzing dense output from distributed grid search-checkpoint.ipynb 72B
analyzing dense output from distributed grid search.ipynb 72B
LICENSE 1KB
example.log 208KB
mccExcludedFiles.log 102B
mccExcludedFiles.log 102B
return_CollTime_test.m 9KB
ratePfit.m 421B
ratePfit2.m 412B
ratePfit3.m 412B
parforWaitbar.m 318B
rrate2.m 279B
rrate.m 229B
README.md 615B
report.mldatx 36KB
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model_comparison_r_0.1_D_2.0_k_10.png 307KB
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model_comparison_r_0.1_D_1.5_k_100.png 299KB
model_comparison_r_1.0_D_0.5_k_100.png 297KB
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model_comparison_r_0.1.png 221KB
model_comparison_r_0.5_k_100.png 185KB
colltimes.png 183KB
collrates.png 168KB
lib_return_CollTime_test.prj 59KB
return_CollTime_test.prj 59KB
parse_output.py 2KB
compute_slope.py 1KB
gen_run_1.py 633B
my_initialization-checkpoint.py 611B
my_initialization.py 609B
__init__.py 28B
my_initialization.cpython-38.pyc 758B
return_CollTime_test 663KB
run_return_CollTime_test.sh 1KB
run_unScaledReactionSim_return_collRate_test.sh 908B
goto-rapids.sh 624B
logdown.sh 532B
matcc.sh 379B
xrun.sh 203B
runsim.sh 148B
gcc.sh 139B
post_process.sh 93B
local-main.sh 90B
run_return_pi.sh 61B
retab.sh 50B
gen_run_1.sh 38B
clean-log.sh 34B
compile_return_pi.sh 31B
return-CollTimes-test.submit 596B
return-CollTimes.submit 593B
readme.txt 4KB
readme.txt 4KB
runtimes-of-return_CollTimes.txt 132B
unresolvedSymbols.txt 19B
requiredMCRProducts.txt 18B
requiredMCRProducts.txt 12B
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汪纪霞
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