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MTBC_L1_L3:补充结果和手稿“印度洋沿岸地方性结核分枝杆菌种群的局部适应”的代码
共54个文件
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2021-03-17
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与该出版物有关的补充信息,数据和代码:印度洋边缘地方性结核分枝杆菌种群的局部适应性。 Menardo等。 (2021年) DOI:10.12688 / f1000research.28318.1 文件夹Supplementary_text_figures_tables包含补充文本,图形和表格 文件夹Dating_beast包含用于约会分析的xml文件 文件夹EsxH_haplotype_association_test包含代码和输入文件,用于执行不同单倍型与地理区域之间的关联测试 文件夹EsxH_PAML包含用于对EsxH执行肯定选择分析的控制文件和输入文件 Mascot文件夹包含用于Mascot分析的xml文件 Supplementary_file_1.html:L1(压缩树)的PASTML结果 Supplementary_file_2.html:L1的PASTML结果,完整树 Su
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MTBC_L1_L3-main.zip (54个子文件)
MTBC_L1_L3-main
Supplementary_file_1.html 181KB
Supplementary_file_4.html 888KB
Supplementary_file_2.html 1.84MB
Supplementary_file_3.html 119KB
Dating_beast
L3_s1_BSP.xml 6.56MB
L1_s2_exp.xml 16MB
L3_s1_BSP_NS.xml 6.56MB
L1_s1_exp.xml 15.83MB
L1_s3_exp.xml 15.39MB
L3_s2_BSP.xml 6.79MB
L3_s3_BSP.xml 7.09MB
L3_s2_exp.xml 6.79MB
L3_s1_exp.xml 6.56MB
L3_s3_exp_NS.xml 7.08MB
L3_s2_exp_NS.xml 6.79MB
L3_s3_BSP_NS.xml 7.09MB
L3_s3_exp.xml 7.08MB
L3_s2_BSP_NS.xml 6.79MB
L3_s1_exp_NS.xml 6.56MB
LICENSE 34KB
README.md 1KB
EsxH_PAML
Rv0288_L3_500.phy 146KB
codeml_esxH_L3.ctl 2KB
Rv0288_L1_500.phy 146KB
codeml_esxH_L4.ctl 2KB
codeml_2_esxH_L4.ctl 2KB
codeml_2_esxH_L3.ctl 2KB
Rv0288_L3_500.phy_tree 13KB
codeml_2_esxH_L1.ctl 2KB
Rv0288_L2_500.phy 146KB
Rv0288_L2_500.phy_tree 13KB
Rv0288_L4_500.phy 146KB
codeml_2_esxH_L2.ctl 2KB
RAxML_bestTree.esxH_L3_500 27KB
Rv0288_L1_500.phy_tree 13KB
RAxML_bestTree.esxH_L2_500 27KB
codeml_esxH_L1.ctl 2KB
RAxML_bestTree.esxH_L4_500 27KB
Rv0288_L4_500.phy_tree 13KB
RAxML_bestTree.esxH_L1_500 27KB
codeml_esxH_L2.ctl 2KB
Supplementary_text_figures_tables
Sup_Table1.xlsx 750KB
Sup_Table8.xlsx 48KB
Sup_Table7.xlsx 105KB
Supplementary_text_figures_tables.pdf 2.61MB
Sup_Table10.xlsx 20KB
Mascot
L1_Mascot.xml 10.87MB
L3_Mascot.xml 5.49MB
EsxH_haplotype_association_test
L1_L3_metainfo_2.0 395KB
phy_C_A10X_mutations_all_reg.R 4KB
phy_C_all_mutations_all_reg.R 5KB
phy_C_A10V_mutations_all_reg.R 5KB
RAxML_bestTree.L1_country 111KB
esxH_HAP 110KB
共 54 条
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chsqi
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