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scala-bigcollections:长索引的Scala的位和双打大集合
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2021-05-08
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描述 Scala BigCollections提供按Long值索引的集合,这意味着它们不限于标准集合之类的20亿个元素。 动机 Scala BigCollections的目标是提供一些简单的集合,这些集合可以容纳实际上可以容纳在内存中的尽可能多的元素。 现代服务器拥有数百GB的可用内存,通过在单个节点上执行所有计算,可以使某些应用程序在操作上保持简单。 最初设想的BigCollections用例是一种用于人类基因组上表观遗传标记的分析软件。 由于参考基因组是30亿个碱基对,因此Int.MaxValue的位图或整数数组将不起作用。 Bed和BigBed之类的格式是此类信息的标准传输方式,但是它们似乎并不能直接转换为内存中的表示形式,该表示形式简单易行,并且可以对大量样本进行大规模计算。 未来的工作 希望看一下H2O使用的压缩技术。 改进的测试套件-我的笔记本电脑不需要执行所有可能的测试所需的
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scala-bigcollections-master.zip (15个子文件)
scala-bigcollections-master
.gitignore 110B
project
build.properties 18B
src
main
scala
com
jasonmar
ByteUtil.scala 2KB
BigCollection.scala 2KB
BigBitMap.scala 4KB
BigVector.scala 3KB
BitMap.scala 3KB
test
scala
com
jasonmar
UnitSpec.scala 712B
BigCollectionSpec.scala 2KB
BigBitMapSpec.scala 3KB
BitMapSpec.scala 3KB
LICENSE 11KB
README.md 2KB
NOTICE 106B
build.sbt 155B
共 15 条
- 1
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BugHunter666
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