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HDDA-SynthenyPlot:该存储库包括一种将基因组数据可视化为合成散点图的方法
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2021-05-12
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散点图 该存储库提供了一种将基因组数据可视化为散点图的方法,以找到同义部分。 很高兴知道 该项目是Justus-Liebig-University Giessen的M-BS2-S4B SS2015的表演。 对于概述,使用并修改了。 由于d3.brush和d3.zoom都在拖动时触发,因此未进行刷洗。 寻找基因组/基因的链接是硬编码的。 搜索模式是单独的。 长度是从起点和终点算起的。 当您使用环状基因组时,这可能是个问题。 要求 数据文件为JSON。 请参阅文件文件夹中的示例。 Javascript库和 。 用法 在概述中,单击要详细查看的图。 在单个视图中,您可以放大和缩小。 也可以通过单击标记点并将它们放入表格中。 右键单击圆点可以单击到基因和基因组的链接。 数据 来自的文件“ data_sets / Arabidopsis / Arabidopsis.Release5.matchL
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HDDA-SynthenyPlot-master.zip (10个子文件)
HDDA-SynthenyPlot-master
Syntheny_Scatterplot_SH_JS_RG
public_html
js
libs
underscore-min.js 16KB
scattermatrix.js 26KB
css
styles.css 2KB
index.html 1003B
files
json_example.json 1KB
Arabidopsis.json 5MB
nbproject
project.properties 369B
project.xml 344B
private
private.properties 36B
README.md 3KB
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葵烟
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