parSRA:并行执行短读对齐器的可移植框架-开源

parSRA是在计算集群上执行短读对齐器的框架。 它使用以下技术来提高可伸缩性：1）使用大多数当前Linux发行版中可用的FUSE内核模块，快速拆分输入读取； 2）基于UPC ++的共享锁的读取的按需均衡分发，这是对C ++的扩展，用于并行计算，遵循分区全局地址空间（PGAS）范式。 parSRA是可移植的，因为它的配置文件允许用户并行执行现有SRA工具的执行，而无需修改parSRA或aligner的源代码。