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tictax:Web服务的流序列分类✓:pushpin:
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2021-05-08
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tictax:Web服务的流序列分类 使用One Codex和EBI API从命令行或Python快速便捷地实现最低的祖先(LCA)分配。 以正确的方向吹风,每秒可发出约100个请求。 使用EBI分类API检索科学名称和谱系,并在fasta描述字段中进行注释,以方便查看和解析。 Tictax当前仅支持One Codex分类。 基于BLAST的LCA(缓慢,敏感)即将推出 命令行用法 $ tictax kmer-lca test.fa $ tictax kmer-lca --progress test.fa > test.tt.fa 内置帮助 $ tictax -h usage: tictax [-h] {kmer-lca} ... positional arguments: {kmer-lca} kmer-lca Lowest common ancestor sequ
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tictax-master.zip (16个子文件)
tictax-master
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.gitignore 1KB
demo_progress.gif 226KB
requirements.txt 193B
LICENSE 34KB
tictax
__init__.py 22B
cli.py 3KB
tests
test.fa.gz 25KB
test_tictax.py 2KB
test.fa 81KB
test.fq.gz 548B
test.fq 2KB
tictax.py 11KB
README.md 3KB
demo.gif 442KB
tox.ini 72B
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李韩资
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