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pafpy:一个轻量级的库,用于处理PAF(成对mApping格式)文件
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2021-05-24
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帕菲 一个轻量级的库,用于处理 (成对mApping格式)文件。 文档: : 目录 安装 皮皮 pip install pafpy conda conda install -c bioconda pafpy 在本地 如果您想在本地安装,建议的方法是使用poetry 。 git clone https://github.com/mbhall88/pafpy.git cd pafpy make install # to check the library is installed run poetry run python -c " from pafpy import PafRecord;print(str(PafRecord())) " # you should see a (unmapped) PAF record printed to the terminal
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pafpy-master.zip (43个子文件)
pafpy-master
poetry.lock 30KB
.gitignore 4KB
pafpy
pafrecord.py 13KB
__init__.py 2KB
__version__.py 22B
strand.py 627B
paffile.py 5KB
tag.py 4KB
utils.py 1KB
Makefile 3KB
pyproject.toml 1KB
CONTRIBUTING.md 3KB
LICENSE 1KB
CHANGELOG.md 1KB
.github
workflows
ci.yaml 1KB
release.yaml 713B
scripts
mdpydoctest 9KB
README.md 3KB
tests
stream.py 0B
test_tag.py 3KB
demo.paf.gz 126B
test_paffile.py 4KB
test_utils.py 3KB
demo.paf 131B
test_pafrecord.py 15KB
.flake8 476B
docs
paffile.html 26KB
USAGE.md 7KB
templates
html.mako 13KB
credits.mako 0B
pdf.mako 4KB
text.mako 3KB
css.mako 10KB
config.mako 3KB
head.mako 291B
logo.mako 256B
tag.html 26KB
strand.html 13KB
pafrecord.html 69KB
index.html 31KB
utils.html 14KB
logo.png 15KB
CNAME 9B
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男爵兔
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