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tact:完整树木的分类法添加
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2021-04-05
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TACT-完整树的分类法添加 使用出生-死亡模型模拟的分类法为骨干系统发育增加提示 安装 TACT需要Python3。如果可能,我们建议使用PyPy 3实现,因为它可以显着加快TACT分析的速度,尤其是在大型数据集上。 此外,TACT取决于click,DendroPy,NumPy和SciPy软件包。 码头工人 用户发现这是最简单的方法。 安装并运行以下命令下载TACT映像: docker pull jonchang/tact:latest 然后,从容器映像运行TACT,使它可以访问您当前的工作目录: mkdir -p examples cd examples curl -LO https://raw.githubusercontent.com/jonchang/tact/HEAD/examples/Carangaria.csv curl -LO https://raw.github
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tact-master
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dependabot.yml 343B
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Dockerfile 795B
tact
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cli_add_taxa.py 24KB
fastmrca.py 915B
tests
test_create_clade.py 800B
test_bd_optim.py 532B
test_convert.py 676B
data
weirdness.taxonomy.tre 91B
stem.taxonomy.tre 83B
short_branch.backbone.tre 319B
intrusion.backbone.tre 698B
short_branch.taxonomy.tre 3KB
stem2.taxonomy.tre 125B
intrusion.taxonomy.tre 3KB
stem.backbone.tre 30B
stem2.backbone.tre 447B
weirdness.backbone.tre 304B
conftest.py 648B
test_lik_constant.py 1KB
__init__.py 0B
test_yule.py 406B
test_add_taxa_integration.py 4KB
LICENSE 1KB
examples
Carangaria.tre 17KB
Carangaria.csv 97KB
README.md 778B
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男爵兔
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