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pubmedTools:一个R包,用于辅助用户使用pubmed API将信息检索到表中
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pubmedTools 'pubmedTools'是一个R软件包,可帮助研究人员使用Entrez编程实用程序(E-utilities)从PubMed中提取数据 强烈建议注册一个NCBI帐户并创建一个API密钥。 该工具包含使用提供的PubMed ID或PubMed Central ID检索元数据(如DOI,pdf链接,期刊,年份,作者,通讯作者,隶属关系等)的不同功能。 例子: install.packages( " devtools " ) devtools :: install_github( " shihikoo/pubmedTools " ) library( pubmedTools ) searchTerm = " pinkeye " output <- RetriveMetaDataFromSearch( searchTerm , columns = c( " pm
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pubmedTools:一个R包,用于辅助用户使用pubmed API将信息检索到表中 (155个子文件)
test.csv 10KB
DESCRIPTION 556B
.gitignore 73B
.gitignore 11B
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stringdist_0.9.5.2.tar.gz 810KB
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README.md 1KB
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pmcRead.R 26KB
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ReadMetaDataFromPmcidEfetchDoc.Rd 1KB
RetriveMetaDataFromPubmedEfetch.Rd 1020B
extractCorrespondingAuthorIdFromPmcidEfetchDoc.Rd 943B
extractAffliationFromPmcidEfetchDoc.Rd 883B
extractCorrespondingAuthorFromPmcidEfetchDoc.Rd 816B
RetriveMetaDataFromPmidsBatch.Rd 809B
extractCorrespondindAuthorAffliationFromPmcidEfetchDoc.Rd 780B
Retrive_pmid_with_TitleYear.Rd 745B
DownloadJsonWithPmidsBatch.Rd 736B
DownloadXMLWithPmidsBatch.Rd 730B
extractEpubDateFromPmcidEfetchDoc.Rd 729B
RetriveMetaDataFromPubmedEfetchParallel.Rd 729B
RetriveUrlFromPubmedElink.Rd 712B
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