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mmtf-pyspark:使用MMTF和Apache Spark并行和分布式分析和挖掘蛋白质数据库的方法
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mmtf-pyspark:使用MMTF和Apache Spark并行和分布式分析和挖掘蛋白质数据库的方法
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bld.bat 115B
setup.cfg 198B
1hv4.cif 900KB
custom.css 446B
Dockerfile 2KB
.gitignore 1KB
3hdb.pdb.gz 81KB
1HV4.mmtf.gz 72KB
4HHB.mmtf.gz 39KB
1J6T.mmtf.gz 36KB
1stp.cif.gz 32KB
MANIFEST.in 19B
MetalInteractionsAdvanced.ipynb 122KB
MetalInteractionsAdvanced.ipynb 122KB
FilterByExperimentalMethods.ipynb 81KB
SecondaryStructureShiftedWord2VecEncoder.ipynb 77KB
SecondaryStructureShiftedWord2VecEncoder.ipynb 77KB
LigandInteractionDemo.ipynb 68KB
PdbDrugBankMapping.ipynb 58KB
PdbDrugBankMapping.ipynb 58KB
WaterInteractionsExample.ipynb 57KB
WaterInteractionsExample.ipynb 57KB
DataAnalysisExample.ipynb 52KB
InteractionAnalysis.ipynb 41KB
FilterByExperimentalMethods.ipynb 40KB
ProteinChainClassification.ipynb 36KB
ProteinChainClassification.ipynb 30KB
UniProtDemo.ipynb 28KB
UniProtDemo.ipynb 28KB
MetalInteractionsExample.ipynb 26KB
JpredDemo.ipynb 26KB
PolymerInteractionsDemo.ipynb 24KB
JpredDemo.ipynb 23KB
PDBMetaDataDemo.ipynb 21KB
PDBMetaDataDemo.ipynb 21KB
MetalInteractionsExample.ipynb 20KB
SecondaryStructureWord2VecEncoder.ipynb 20KB
SecondaryStructureWord2VecEncoder.ipynb 19KB
SwissProtSequenceToWord2Vec.ipynb 17KB
SwissProtSequenceToWord2Vec.ipynb 17KB
SiftsDataDemo.ipynb 16KB
SiftsDataDemo.ipynb 16KB
SecondaryStructureBlosum62EncoderDemo.ipynb 15KB
SecondaryStructureBlosum62EncoderDemo.ipynb 15KB
SecondaryStructureOneHotEncoderDemo.ipynb 14KB
SecondaryStructureOneHotEncoderDemo.ipynb 14KB
InteractionAnalysisAdvanced.ipynb 13KB
InteractionAnalysisAdvanced.ipynb 12KB
ProteinFoldDatasetCreatorDemo.ipynb 10KB
ProteinFoldDatasetCreatorDemo.ipynb 10KB
DrugBankDemo.ipynb 9KB
SecondaryStructurePropertyEncoderDemo.ipynb 9KB
SecondaryStructurePropertyEncoderDemo.ipynb 9KB
NotFilterDemo.ipynb 8KB
SwissModelDataset.ipynb 8KB
SwissModelDataset.ipynb 8KB
InteractionAnalysisSimple.ipynb 7KB
KeywordSearchDemo.ipynb 7KB
InteractionAnalysisSimple.ipynb 7KB
CustomReportDemo.ipynb 7KB
SecondaryStructureSegmentDemo.ipynb 7KB
ATPInteractionAnalysis.ipynb 7KB
FilterByPolymerChainTypeDemo.ipynb 6KB
AdvancedSearchDatasetDemo.ipynb 6KB
GettingStarted.ipynb 6KB
DrugBankDemo.ipynb 6KB
LigandInteractionFingerprintDemo.ipynb 6KB
DSSPDemo.ipynb 6KB
FilterByPolymerChainTypeDemo.ipynb 6KB
SecondaryStructureElementsWord2VecEncoder.ipynb 5KB
WriteMmtfCustomSubsetDemo.ipynb 5KB
PrintSparkSettings.ipynb 5KB
SecondaryStructureElementsWord2VecEncoder.ipynb 5KB
PolymerInteractionFingerprintDemo.ipynb 5KB
KeywordSearchDemo.ipynb 5KB
FilterBySequenceRegexDemo.ipynb 5KB
CustomReportDemo.ipynb 5KB
FilterProteinDnaComplexesDemo.ipynb 5KB
SequenceSimilarityDemo.ipynb 5KB
FilterByResolutionDemo.ipynb 5KB
FilterByGroupsDemo.ipynb 5KB
FilterByDepositionDateDemo.ipynb 4KB
CreateRepresentativeSetDemo.ipynb 4KB
WriteMmtfSubsetDemo.ipynb 4KB
WriteMmtfFullUncompressedDemo.ipynb 4KB
FilterByRFreeDemo.ipynb 4KB
FilterExclusivelyByLProteinDemo.ipynb 4KB
DownloadMmtfFilesDemo.ipynb 4KB
FilterByReleaseDateDemo.ipynb 4KB
ReadLocalMMTFReducedDemo.ipynb 4KB
ReadLocalMMTFFullDemo.ipynb 4KB
FilterProteinDnaComplexesDemo.ipynb 4KB
MapToListDemo.ipynb 4KB
FilterByResolutionDemo.ipynb 4KB
FilterBySequenceRegexDemo.ipynb 4KB
MapToListDemo.ipynb 4KB
NotFilterDemo.ipynb 4KB
WildTypeQueryDemo.ipynb 4KB
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