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Kive:生物信息管道和数据的归档和自动化
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2021-04-08
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基夫 Kive是一个可访问的计算框架,用于生物信息管道及其输入和输出数据集的版本控制。 背景 生物信息学“管道”是用于处理和分析生物数据的软件程序的集合。 管道已成为现代生物医学和临床实验室中必不可少的工具。 大多数管道都是经过定制的,可以满足每个实验室和项目的要求。 因此,它们通常处于不断发展中。 最终用户通常不知道对管道进行的修订。 很难确定使用哪个版本的管道来处理给定的数据集,尤其是在有多个结果副本的情况下。 这使得难以再现用于方法验证或发布的结果。 临床实验室认证计划(例如,美国病理学家学院(CAP))对生物信息学管道的验证和版本跟踪发布了新的要求。 跟踪此信息的系统应该可以查找任何数据集的管道历史记录。 它应该易于使用,直观的图形界面以及尽可能多的自动“簿记”功能。 我们找不到符合这些条件的系统。 Kive是做什么的? 我们开发了作为Django应用程序的新框架
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Kive:生物信息管道和数据的归档和自动化 (1115个子文件)
AUTHORS 317B
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noop.bash 28B
noop.bash 28B
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slurm.conf 4KB
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slurmdbd.conf 906B
slurmdbd.conf 906B
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001-kive.conf 373B
envvars.conf 294B
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cgroup.conf 175B
cgroup.conf 175B
org.eclipse.wst.jsdt.ui.superType.container 49B
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.coveragerc 26B
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step_0_triplet.csv 73B
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火器营松老三
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