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Intro_to_Coalescent_Workshop:讲习班的材料介绍了合并模型以及如何使用ms模拟数据。 最初于2015年...
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2021-05-20
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#介绍联盟 这些材料用于简要介绍合并模型,并提供使用ms运行合并模拟的经验(Hudson 2002)。 他们最初于2015年7月在多特学院(Dordt College)任教。 ##讲座 讲座文件夹包含四个讲座: 介绍合并 遗传变异总结 基本合并的扩展:人口结构,增长和重组 使用合并数据模拟表型(自然选择除外) ##实验室 实验室文件夹包含三个用R Markdown编写的实验室。 一些Linux命令行基础知识,安装ms,解释ms输出 使用程序sample_stats,探索缩放的突变率与摘要统计量之间的关系 结合,人口增长和人口结构的联合模拟 它还包括脚本Coalescent_sfs.pl,该脚本根据ms模拟输出计算平均SFS。
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Intro_to_Coalescent_Workshop-master.zip (13个子文件)
Intro_to_Coalescent_Workshop-master
Labs
coalescent_sfs.pl 4KB
lab2.html 649KB
lab2.Rmd 6KB
lab1.Rmd 10KB
lab1.html 437KB
lab3.Rmd 16KB
lab3.html 685KB
Readme.md 1000B
Lectures
Lecture3.pdf 2.28MB
Lecture2.pdf 758KB
Lecture4.pdf 1.55MB
Lecture1.pdf 1.42MB
.gitignore 0B
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