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ecg_ptbxl_benchmarking:与“用于ECG分析的深度学习”相关的公共存储库
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2021-05-14
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用于ECG分析的深度学习:PTB-XL的基准和见解 该存储库随附我们的文章 ,该文章建立在基础上。 它允许重现本文所述的ECG基准测试实验,并在我们的框架内对用户提供的模型进行基准测试。 我们还在本页上描述的PTB-XL数据集上保持排行榜的排名,因此请随时将结果作为PR提交。 请引用以下参考文献中列出的相应文章来感谢我们的工作。 设置 安装依赖项 通过创建conda环境来安装依赖项(wfdb,pytorch,torchvision,cudatoolkit,fastai,fastprogress): conda env create -f ecg_env.yml conda activate ecg_env 取得资料 通过以下bash脚本下载并准备数据集(PTB-XL和ICBEB): ./get_datasets.sh 该脚本首先下载并将其存储在data/ptbxl/ 。 之后,将下
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ecg_ptbxl_benchmarking-master.zip (49个子文件)
ecg_ptbxl_benchmarking-master
output
exp0
val_bootstrap_ids.npy 1.77MB
models
fastai_xresnet1d101
y_val_pred.npy 834KB
models
tmp.pth 7.49MB
fastai_xresnet1d101.pth 21.93MB
results
val_results.csv 191B
tr_results.csv 191B
te_results.csv 110B
losses.png 23KB
y_test_pred.npy 837KB
lr_find.png 19KB
y_train_pred.npy 6.48MB
naive
y_val_pred.npy 1.75MB
y_test_pred.npy 1.76MB
y_train_pred.npy 13.91MB
train_bootstrap_ids.npy 14.14MB
test_bootstrap_ids.npy 1.78MB
data
standard_scaler.pkl 474B
y_train.npy 9.45MB
mlb.pkl 1KB
y_val.npy 1.19MB
y_test.npy 1.19MB
get_datasets.sh 969B
code
Finetuning-Example.ipynb 18KB
experiments
scp_experiment.py 11KB
utils
utils.py 17KB
__init__.py 0B
convert_ICBEB.py 2KB
stratisfy.py 8KB
models
timeseries_utils.py 25KB
wavelet.py 7KB
xresnet1d.py 9KB
inception1d.py 4KB
rnn1d.py 3KB
your_model.py 476B
__init__.py 0B
fastai_model.py 23KB
basic_conv1d.py 10KB
base_model.py 210B
resnet1d.py 10KB
configs
your_configs.py 104B
__init__.py 0B
fastai_configs.py 6KB
wavelet_configs.py 482B
reproduce_results.py 1KB
__init__.py 0B
LICENSE 34KB
README.md 17KB
.gitignore 139B
ecg_env.yml 5KB
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