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peddep:Dharia NV的代码等。 第一代小儿癌症依赖图。 自然遗传学 2021
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2021-05-30
06:37:34
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佩德普 “第一代儿童癌症依赖图”代码(Nature Genetics 2021) 这是用于运行分析并生成 Dharia 等人在 Nature Genetics 2021 上发表的“第一代儿科癌症依赖图”的数据的代码。 为了执行 R-markdowns 和其他代码,必须从 figshare 10.6084/m9.figshare.13516208 下载附加数据。 这四个文件夹应该解压到代码的根目录下,以便所有命令都能正确执行。 每个 R-markdown 执行一组特定的分析并生成如下图面板。 通常,它们可以按照下面列出的顺序运行,以确保在运行一段代码之前满足所有数据依赖性。 Cell_Line_Features_Figures.Rmd:生成热图/数据集,描述儿科癌细胞系中反复发生的变化。 CNA_Figures.Rmd:生成与细胞系拷贝数改变相关的图形/数据集。 Dependen
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