epivizFileServer:Python库可查询和转换索引文件中的基因组数据

Epiviz文件服务器 基因组文件的计算和查询解析器 描述 Epiviz文件服务器是一个Python库，用于查询基因组文件，不仅用于可视化，而且用于转换。 该库提供了执行各种任务的各种模块--解析器读取各种基因组文件格式；-查询以仅访问文件的必需字节；-计算以对数据进行转换；-服务器以将数据集立即转换为API；以及-可视化。 -库及其功能的简要概述，以提供一个IPython的笔记本在描述 笔记 该库要求托管数据文件的服务器支持HTTP范围请求，以便文件服务器的解析器模块只能请求处理查询所需的必要字节范围。 该库当前支持索引的基因组文件格式，例如BigWig，BigBed，Bam（带bai），Sam（带sai）或任何可以使用tabix进行索引的基因组数据文件。 开发者须知 该项目是使用PyScaffold 3.1设置的。 有关PyScaffold的详细信息和使用信息，请参见 。 使用