CStone-开源

CStone 是 RNA-Seq 数据的从头组装器，它使用 de Bruijn 样图并注释每个 contig 产生的三个图分类级别之一，表明它是否可以保证是非嵌合的。 分类级别取决于读取读数的基因家族的复杂性。 作为副产品，这也提供了对已测序潜在基因家族结构构成的洞察。 它已经在模拟和真实数据上进行了测试，并针对两个广泛建立的从头组装程序 Trinity 和 rnaSPAdes 进行了基准测试。 更多细节将很快在我们的论文中提供。 葡萄牙科学技术基金会 FCT 通过项目 PTDC/BIA-EVL/29115/2017 支持这项工作。 John Archer 和 Raquel Linheiro 得到了基金的支持，编号为 POCI-01-0145-FEDER-029115。