metaseq-biotrac56:NIH FAES Bio-Trac 56 上 metaseq 演示的材料 (http

概述 该存储库用作 Bio-Trac 56 RNA-seq 课程的一部分。 快速浏览 不想下载数据或安装任何东西？ 您可以在此处查看渲染的笔记本： 或者，您可以下载此存储库中的 PDF 版本以供离线查看。 存储库中的文件 de-example.ipynb : 一个 IPython Notebook 来演示一些差异表达分析 heatmap-example.ipynb ：一个用于演示与 ChIP-seq 数据集成的 IPython 笔记本 processor.py ：用于后处理从 .ipynb 文件创建的 .py 文件 prepare-output.sh : 准备文件的脚本 download_data.bash下载演示中使用的所有数据 RNA-seq.R : R 脚本对下载的 RNA-seq 数据执行差异表达 设置 为了在您自己的计算机上运行 IPython 笔记本，您需要安装该软件并下载数