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seirsplus:具有扩展功能的SEIRS流行病动力学模型,包括网络结构的人口,测试,接触者追踪和社会隔离
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SEIRS +模型框架 该软件包实现了带有扩展功能的广义SEIRS传染病动态模型,使我们能够研究社交联系网络结构,异质性,随机性和干预措施(如社交距离,测试,联系追踪和隔离)的影响。 最新版本:v1.0(2020年8月9日) 全面推出, 以及面向和人口的。 示例笔记本,其中包含复杂的和模拟的深入演练。 和类已被重构,以符合约定。 动态和核心实现保持不变,但是某些变量名称已更改,等等。 2020年8月9日之前的这些类的版本现在位于legacy_models.py模块中。 启动新的以全面记录模型和包装特征 总览 可以上找到该软件包的模型,代码,用例,示例等的完整文档。 SEIRS动力学 该软件包中模型的基础是经典的传染病SEIR模型。 SEIR模型是标准的隔离模型,其中将种群分为易感(S) ,暴露(E) ,传染性(I)和恢复(R)个体。 与感染个体进行传染性接触时,该种群中的易感成员被感染(暴露),然后进入感染状态,最终恢复。 在SEIRS模型中,恢复的个体可能在恢复后的某个时间变得易感(尽管如果不适用或不期望,则可以排除易感性)。 扩展的SEIRS模型 该模型扩展了经典的传染病S
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seirsplus:具有扩展功能的SEIRS流行病动力学模型,包括网络结构的人口,测试,接触者追踪和社会隔离 (109个子文件)
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.DS_Store 6KB
.DS_Store 6KB
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Extended_SEIRS_Community_TTI_Demo-checkpoint.ipynb 399KB
Extended_SEIRS_Community_TTI_Demo.ipynb 399KB
Extended_SEIRS_Workplace_TTI_Demo.ipynb 365KB
Extended_SEIRS_Workplace_TTI_Demo-checkpoint.ipynb 365KB
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Legacy_network_model_demo.ipynb 217KB
Basic_SEIRS_Meanfield_Model_Demo.ipynb 103KB
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Basic_SEIRS_Meanfield_Model_Demo-checkpoint.ipynb 99KB
Legacy_deterministic_model_demo.ipynb 99KB
Basic_SEIRS_Network_Model_Demo-checkpoint.ipynb 55KB
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networks.py 40KB
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SOURCES.txt 369B
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