metasort:通过减少微生物群落的元基因组组装者-开源

当前大多数方法都是在参考基因组的参与下分析宏基因组学数据。 然而，新型的微生物群落远远超出了参考数据库的范围，而复杂微生物群落的从头基因组组装仍然是一个巨大的挑战。 在这里，我们介绍了一种新颖的实验和生物信息学框架metaSort，用于从宏基因组学样本中有效构建细菌基因组。 MetaSort提供了一种基于流式细胞仪和单细胞测序方法的分类微型元基因组方法，并采用新的计算算法，通过原始元基因组的补充，从分类后的微型元基因组中有效地回收了高质量的基因组。 通过对模拟数据集，唾液和肠道微生物组的广泛评估，我们证明了metaSort在基因组恢复和装配方面具有出色且公正的性能。