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PyBMRB:使用python Plotly的BMRB数据可视化工具
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2021-05-10
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聚吡咯 单击启动器,在实时Jupyter Notebook上尝试PyBMRB。 生物磁共振数据库(BMRB) 收集,注释,存档和分发(在全球范围内在公共领域中)从生物大分子和代谢物的NMR光谱研究得出的重要光谱和定量数据。 目的是使科学家能够对生物系统的结构,动力学和化学进行分析,并支持生物分子NMR光谱学领域的进一步发展。 BMRB将其数据保存在关系数据库中,并以格式保存为平面文件。 它还通过API提供数据访问,并提供处理NMR-STAR文件的软件工具。 是一种这样的工具,可以方便地读取,写入和解析NMR-STAR文件。 增强了BMRB数据和数据访问的可用性,以及来自BMRB的化学位移数据的可视化。 数据可视化 PyBMRB采用现代Python可视化工具其可视化。 它具有来自BMRB数据库的标准氨基酸的化学位移直方图和NMR-STAR格式的任何给定BMRB条目(或)BMRB条目列表
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PyBMRB-master.zip (39个子文件)
PyBMRB-master
_config.yml 26B
.gitignore 1KB
README.md 5KB
LICENSE 1KB
index.ipynb 5KB
binderlog.py 831B
requirements.txt 45B
setup.py 788B
jupyter.md 409B
pybmrb
examples
n15hsqc.html 446KB
histogram.ipynb 6KB
n15hsqc.ipynb 5KB
histogram.html 11.34MB
csviz.py 58KB
__init__.py 20B
data
test.str 240KB
nn_pp_H_3.txt 27.4MB
nn_pp_N_2_filtered.txt 1.28MB
nn_pp_N_1.txt 565KB
nn_pp_N_0.txt 1KB
LACSCA.html 2.94MB
LACS.html 2.95MB
nn_pp_H_0.txt 1KB
nn_pp_N_1_filtered.txt 551KB
nn_pp_N_2.txt 20.78MB
nn_pp_H_0_filtered.txt 1KB
nn_pp_N_3_filtered.txt 842KB
nn_pp_H_2_filtered.txt 1.43MB
LACSCO.html 2.94MB
nn_pp_H_1_filtered.txt 554KB
nn_pp_H_3_filtered.txt 956KB
LACSHN.html 2.94MB
LACSCB.html 2.94MB
nn_pp_N_0_filtered.txt 1KB
nn_pp_H_2.txt 20.74MB
2m07_1_A.lacs_out 22KB
nn_pp_H_1.txt 569KB
LACSNH.html 2.94MB
nn_pp_N_3.txt 27.31MB
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泰国旅行
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