reg-gen:监管基因组学工具箱

RGT-监管基因组学工具箱 RGT是一个开放源代码的Python 3.6+库，用于分析监管基因组学。 RGT以面向对象的方式进行编程，其核心类提供了用于处理法规基因组数据的功能。 该工具箱由一个和几个工具组成： ：ChIP-Seq差分峰调用程序，替代 ：TBFS匹配和丰富化 ：DNase-Seq覆盖方法 ：可视化工具 ：DNA / RNA三重域查找器 安装 不再支持Python 2。 获得RGT的最快和最简单的方法是使用pip。 首先是一些依赖： pip install --user cython numpy scipy 然后安装带有所有其他依赖项的完整RGT套件： pip install --user RGT 另外（但不推荐），您可以克隆此存储库： git clone https://github.com/CostaLab/reg-gen.git 或下载特定，然后继