凯格动画路径
kegg-animate-pathway是基于的命令行实用程序,可与 API交互以产生代谢途径的动画图,以揭示其基因和/或化合物的活性。
这是一个例子:
覆盖层的颜色,大小和模糊可以随意修改。 例如,这是一条相同的路径,但是叠加层被模糊和放大,并使用了蓝色至黄色的调色板:
安装
$ pip install https://github.com/ajmazurie/kegg-animate-pathway/zipball/master
用法
在命令行上使用kegg-animate-pathway ; 选项(通过键入kegg-animate-pathways --help )可用于选择要显示的KEGG途径,用于图形叠加的基因和/或化合物的活性水平,以及用于图形叠加的各种设置,例如尺寸,模糊级别和颜色。 以下是所有这些选项的列表:
usage: kegg-animate
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