SQANTI3:长读长定义转录组的质量控制工具

SQANTI3 SQANTI3 是 SQANTI 工具（）的最新版本，它合并了 SQANTI（）和 SQANTI2（）的功能以及新增功能。 SQANTI3 将继续作为一项集成开发，旨在为您的新长读定义转录组提供最佳表征。 SQANTI3 是框架的第一个模块，其中还包括 IsoAnnot 和 tappAS。 最新更新 当前版本 (07/05/2021)：SQANTI3 版本 4.1 SQANTI3 中实现的新功能 4.1 版： 更改--gtf参数。 现在，默认情况下，SQANTI3 需要一个 GTF 文件作为输入。 通过激活--fasta选项，仍然可以将同种型的序列作为 FASTA 或 FASTQ 文件提供。 修复了报告的新情节和小错误。 4.0 版： 创建 HTML 报告。 使用--report参数，可以选择报告的类型： html （默认）、 pdf 、 both或skip