flair:RNA的全长替代同工型分析

天赋 FLAIR（RNA的全长替代异构体分析），用于校正，异构体定义和嘈杂读段的替代剪接分析。 FLAIR主要用于纳米KongcDNA，天然RNA和PacBio测序读取。 目录 示例文件 引用风情 概述 FLAIR可以选择与短时读取的数据一起运行，以帮助提高长时读取的拼接点的拼接位点准确性。 FLAIR使用多个对齐步骤和拼接位点过滤器，以提高对根据嘈杂数据定义的同工型的置信度。 FLAIR被设计为能够感知来自Tang等人的纳米Kong数据中的细微拼接变化。 （2018） 。 请阅读有关方法的更多说明。 建议通过将校正后的读取的psl或bed文件合并在一起，在进行天赋崩溃之前进行异构化组装之前，将所有样品合并在一起。 从天赋崩溃创建同工型参考之后，后续步骤将分别将每个样品的读数分配给组合组件的同工型，以进行下游分析。 还要注意，可以使用kentUtils bedToPsl或pslToB