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PSIM:PSIM的matlab源代码-ps source code
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2021-03-25
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PSIM卡 Matlab源代码,用于重建偏振结构照明显微镜(PSIM) 该程序是基于fairSIM开发的。 在重建过程中,可以分辨出样品的极化,并以伪彩色模式显示。 PSIM重建需要精确的SIM参数,该参数可从商业SIM系统的随附参数文件中获得或从fairSIM估算得出。 在“输入”文件夹中有一个测试文件。 该程序从根目录下的PSIM.m开始。 UI界面和更多功能正在开发中。 参考: pSIM的原理已在发布。 FairSIM插件(用于ImageJ)可从获得。 fairSIM插件随附的出版物已在《自然通讯》(开放访问)中发表:MarcelMüller,ViolaMönkemöller,Simon Hennig,WolfgangHübner,Thomas Huser(2016年)。 “ ImageJ中超分辨率结构化照明显微镜数据的开源图像重建”,《自然通讯》,doi:10.1
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PSIM-master.zip (33个子文件)
PSIM-master
Output
pSIM_cal.png 1.61MB
sim.tif 2.02MB
cm.png 3KB
functions
applyOtf.m 1KB
writeApoVector.m 528B
writeAttenuationVector.m 639B
fourierShift.m 549B
fadeBorderCos.m 663B
oftmatrix.m 820B
pasteFreq.m 487B
getOtfVal_m.m 913B
PSIM_display.m 1KB
SimParamCreate.m 329B
writeOtfVector.m 779B
maskOtf.m 512B
pasteAndFourierShift.m 328B
otfGenerator.m 1KB
commonRegion.m 1KB
PSIM.m 10KB
README.md 1KB
Input
Note.txt 277B
2.tif 516KB
6.tif 516KB
8.tif 516KB
7.tif 516KB
4.tif 516KB
1.tif 516KB
9.tif 516KB
3.tif 516KB
5.tif 516KB
Calib
calib1.tif 516KB
calib2.tif 516KB
softwareIntroduction.pdf 185KB
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