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疟疾MDR突变体的产生:针对疟疾个体的模拟研究的回购,其中哪些治疗策略在更早产生耐多药突变体方面存在更大的风险
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2021-02-08
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PSU-CIDD-疟疾模拟 - 发行公告 2021年1月25日:文件从冻结的版本从@lizhewen的迁移到此存储库。 来自各种模拟的输出文件和生成的可视化图形也将在此仓库中更新。 此版本(v3.3)专为耐多药(MDR)纸而开发。 这个代码库是基于关党阮Tran的V3.2位于。 此版本实施了Sporozoite挑战代码,并修改了月度报告程序,以在整个模拟过程中输出所有突变对信息。 此版本仅支持单位置模拟。 在mdr_analysis文件夹下,它包含两个用于创建可视化的绘图程序。 请参考Jupyter Notebook ipynb文件(以前ipynb数字命名)以查看可用的MDR图。 输出文件说明 如果选择使用默认的修改后的每月报告者,则将生成两个制表符分隔值(TSV)数据文件和一个逗号分隔值(CSV)。 下表列出了如何组织这两个文件,其中组分隔符由前哨值-1111 。 Monthly
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疟疾MDR突变体的产生:针对疟疾个体的模拟研究的回购,其中哪些治疗策略在更早产生耐多药突变体方面存在更大的风险 (2000个子文件)
Package-Release.bash 2KB
Package-Debug.bash 2KB
Package-Release.bash 1KB
Package-Debug.bash 1KB
easylogging++.cc 119KB
ModelDataCollector.cpp 39KB
Population.cpp 36KB
Person.cpp 27KB
GuiReporter.cpp 20KB
AMUReporter.cpp 17KB
CustomConfigItem.cpp 17KB
FarmReporter.cpp 15KB
SingleHostClonalParasitePopulations.cpp 14KB
Model.cpp 13KB
BurninFarmReporter.cpp 12KB
PopulationEventBuilder.cpp 11KB
ConfigTest.cpp 11KB
ReporterUtils.cpp 10KB
StrategyBuilder.cpp 9KB
main.cpp 9KB
DxGGenerator_main.cpp 7KB
main.cpp 6KB
MMCReporter.cpp 6KB
main.cpp 6KB
ProgressToClinicalEvent.cpp 6KB
ConsoleReporter.cpp 6KB
TACTReporter.cpp 6KB
MonthlyReporterConsole.cpp 5KB
Scheduler.cpp 5KB
MultipleLocationGuiReporter.cpp 5KB
PkPdReporter.cpp 5KB
MonthlyReporter.cpp 5KB
PkPdReporter.cpp 5KB
PkPdReporter.cpp 5KB
MonthlyReporter.cpp 5KB
spdlogTest.cpp 4KB
ImportationPeriodicallyEvent.cpp 4KB
ClonalParasitePopulation.cpp 4KB
BurninMonthlyReporter.cpp 4KB
Random.cpp 4KB
ITreatmentCoverageModel.cpp 4KB
ExternalPopulation.cpp 4KB
PersonIndexByLocationStateAgeClass.cpp 4KB
Genotype.cpp 4KB
PersonIndexByLocationExternalPopulationMovingLevel.cpp 4KB
Drug.cpp 3KB
NestedMFTMultiLocationStrategy.cpp 3KB
DrugsInBlood.cpp 3KB
DrugType.cpp 3KB
Introduce580YMutantEvent.cpp 3KB
MFTRebalancingStrategy.cpp 3KB
PersonIndexByLocationBittingLevel.cpp 3KB
main.cpp 3KB
PersonIndexByLocationMovingLevel.cpp 3KB
MFTMultiLocationStrategy.cpp 3KB
TimeHelpersTest.cpp 3KB
ImmuneSystem.cpp 3KB
EndClinicalDueToDrugResistanceEvent.cpp 3KB
TMEScheduler.cpp 3KB
SingleRoundMDAEvent.cpp 3KB
ImportationEvent.cpp 2KB
IntroducePlas2CopyParasiteEvent.cpp 2KB
NovelDrugSwitchingStrategy.cpp 2KB
GenotypeDatabase.cpp 2KB
AdaptiveCyclingStrategy.cpp 2KB
IntroduceLumefantrineMutantEvent.cpp 2KB
IntroduceAQMutantEvent.cpp 2KB
CirculateToTargetLocationNextDayEvent.cpp 2KB
MoveParasiteToBloodEvent.cpp 2KB
UpdateWhenDrugIsPresentEvent.cpp 2KB
EndClinicalByNoTreatmentEvent.cpp 2KB
TestTreatmentFailureEvent.cpp 2KB
Location.cpp 2KB
CyclingStrategy.cpp 2KB
NestedMFTStrategy.cpp 2KB
MDAAction.cpp 2KB
YearlyReporterV1.cpp 2KB
ImmuneComponent.cpp 2KB
TherapyBuilder.cpp 2KB
IndividualsFileReporter.cpp 2KB
IndividualsFileReporter.cpp 2KB
IndividualsFileReporter.cpp 2KB
WesolowskiSM.cpp 2KB
MoveToExternalPopulationEvent.cpp 2KB
BarabasiSM.cpp 1KB
ReceiveMDATherapyEvent.cpp 1KB
ModifyNestedMFTEvent.cpp 1KB
EndClinicalEvent.cpp 1KB
GeneralGravitySM.cpp 1KB
MFTStrategy.cpp 1KB
Dispatcher.cpp 1KB
ReceiveTherapyEvent.cpp 1KB
MatureGametocyteEvent.cpp 1KB
BirthdayEvent.cpp 1KB
Config.cpp 1KB
RandomTest.cpp 1KB
SwitchImmuneComponentEvent.cpp 1KB
Therapy.cpp 1KB
PersonIndexAll.cpp 1KB
InfantImmuneComponent.cpp 1KB
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