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DNA patterns & application:产生DNA模式的软件-开源
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2021-04-29
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DNA模式代表了一种分析DNA序列的新方法。 一般而言,它可以轻松地检测进化景观中物种之间的关系。 在很大程度上,在生物信息学中,DNA模式方法尚待探索,并且可以通过它获得许多发现。 给出答案的问题之一是:调控基因的启动子类型有几种? 似乎有10种类型的启动子。 该项目还包含20,000张图像(DNA模式),可以对与各种遗传疾病(如果是智人)有关的图像进行分析,或用于了解物种之间的进化机制。 参考文献:[1] Gagniuc和Ionescu-Tirgoviste:真核基因组可能显示多达10类通用的基因启动子。 BMC基因组学2012,13:512。 [2] Gagniuc和Ionescu-Tîrgoviste。 基因启动子在人类中显示染色体特异性并揭示染色体区域,BMC Genomics 2013,14:278。 源代码VB6(Visual Basic 6.0)
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PromKappa and PromNN.rar (36个子文件)
User Manual.doc 412KB
PromKappa
PromKappa source code
Search_gene_names.frm 4KB
chart_comp
Search_gene_names.frx 2KB
CG.frx 118KB
Kappa.bas 426B
blend.bas 1KB
CG.frm 50KB
CG.log 281B
chart
CG.vbw 175B
CG.vbp 950B
PromKappa bin
msvbvm60.dll 1.33MB
scrrun.dll 160KB
chart_comp
VBA6.DLL 1.62MB
PromKappa.exe 364KB
winmm.dll 172KB
chart
MSFLXGRD.OCX 238KB
COMCTL32.OCX 595KB
Comdlg32.ocx 137KB
PromNN
msvbvm60.dll 1.33MB
scrrun.dll 160KB
train
CG-less
4448-11-35-04 AM.jpg 8KB
AT-less
3620-1-43-58 AM.jpg 11KB
CG-based
6-12-46-09 AM.jpg 6KB
CG-spike
4316-1-52-57 AM.jpg 10KB
ATCG-compact
45-1-17-11 PM.jpg 6KB
ATCG-middle
135-10-38-47 AM.jpg 11KB
ATCG-balanced
25-12-46-19 AM.jpg 8KB
ATCG-less
6598-2-33-01 AM.jpg 8KB
AT-spike
2111-1-24-03 AM.jpg 9KB
AT-based
23-3-17-53 PM.jpg 5KB
VBA6.DLL 1.62MB
PromNN.exe 332KB
winmm.dll 172KB
MSFLXGRD.OCX 238KB
COMCTL32.OCX 595KB
sort
AT_spike
ATCG_middle
ATCG_less
ATCG_balanced
CG_less
CG_spike
AT_less
CG_based
AT_based
ATCG_compact
Comdlg32.ocx 137KB
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