oligotyping:通过密切相关的类群的16S rRNA基因标签序列中的细微核苷酸变异探索微生物模式

寡核苷酸分型 寡聚是一种新型的有监督的计算方法，通过利用16S核糖体RNA基因扩增子读数之间的非常细微的核苷酸变异来分解微生物群落中非常密切相关的分类单元。 它可以揭示以前无法观察到的生态模式，以及隐藏在环境数据集中的隐藏多样性。 通过寡聚，取决于超变区，不同类型之间的相似性阈值可以低至0.2％，比OTU聚类方法所使用的事实上的3％相似性阈值低一个数量级。 有关安装和使用说明，请参见项目网页： 执照 该程序是免费软件：您可以根据自由软件基金会发布的GNU通用公共许可证的条款（许可证的版本2）或（根据您的选择）任何更高版本来重新分发和/或修改它。 分发该程序是希望它会有用，但是没有任何保证； 甚至没有对适销性或特定用途适用性的暗示保证。 有关更多详细信息，请参见GNU通用公共许可证。 您应该已经与该程序一起收到了GNU通用公共许可证的副本。 如果没有，请参阅 。