# Bio-Scraper
Web scraper for extracting and tabulating data from biological databases for selected protein sequences.
## Uniprot Scraper
Web scraper for [Uniprot](http://www.uniprot.org/) Protein database
## iPTMnet Scraper
Web scraper for [iPTMnet](https://research.bioinformatics.udel.edu/iptmnet/) database for post-translational modifications (PTMs) in systems biology
### References
1. Ross KE, Huang H, Ren J, Arighi CN, Li G, Tudor CO, Lv M, Lee JY, Chen SC, Vijay-Shanker K, Wu CH iPTMnet: Integrative Bioinformatics for Studying PTM Networks. Methods Mol Biol. 2017;1558:333-353. doi: 10.1007/978-1-4939-6783-4_16. 28150246
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Bio-Scraper:适用于UniProt和iPTMnet数据库的Web抓取工具
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生物刮板 Web刮板,用于从生物学数据库中提取和制表选定蛋白质序列的数据。 Uniprot铲运机 Web刮刀,用于蛋白质数据库 iPTMnet刮板 用于数据库的Web刮板,用于系统生物学中的翻译后修饰(PTM) 参考 Ross KE,Huang H,Ren J,Arighi CN,Li G,Tudor CO,Lv M,Lee JY,Chen SC,Vijay-Shanker K,Wu CH iPTMnet:用于研究PTM网络的集成生物信息学。 方法分子生物学。 2017; 1558:333-353。 doi:10.1007 / 978-1-4939-6783-4_16。 28150246
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Bio-Scraper-master
UniProt-Scraper
scraper.py 13KB
ProteinIDs.csv 15KB
Extracted Data
Comp_bias.csv 42KB
Protein_data.csv 568KB
Secondary_structures.csv 68KB
3D_structures.csv 69KB
README.md 42B
iPTMnet-scraper
data_extraction.py 3KB
formatting.py 647B
ProteinIDs.csv 15KB
Extracted Data
Enzymedata.csv 37B
PTMdata_formatted.csv 2KB
PTMdata.csv 30B
README.md 637B
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哈奇明
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