blastxmlparser:快速的大数据XML解析器和库，用Ruby编写

bio-blastxmlparser blastxmlparser是一个非常快速的并行大数据BLAST XML文件解析器，可以用作命令行实用程序。 使用blastxmlparser可以： 解析BLAST XML 过滤器输出 生成FASTA，JSON，YAML，RDF，JSON-LD，HTML，CSV，表格输出等 而不是将所有内容加载到内存中，而是通过BLAST查询（迭代）来解析XML。 这不仅具有低内存使用的优势，而且还可以尽早显示结果，并且在IO并行继续（磁盘预读）时速度更快。 blastxmlparser是一个命令行实用程序，可用于过滤结果，并且不需要了解Ruby。 快速开始 gem install bio-blastxmlparser gem install parallel # if you want multi-core support blastxmlpar