Python_Bioinformatics_Workshop

BioPython和Python生物信息学研讨会 该存储库包含使用BioPython和其他相关工具的Python生物信息入门讲习班的所有必需文件。 要下载，请单击右上角的大“代码”按钮，或。 讲习班内容 该研讨会介绍了多个基本的生物信息学主题，主要使用BioPython，包括： 访问NCBI数据库（例如，核苷酸序列或分类法）。 使用BioPython读写序列文件。 比对序列（例如，使用MAFFT或Clustal-Omega）。 构建系统树（使用FastTree或IQ-Tree）。 解析这些树并使用ETE-3创建发布质量的树图像。 要求 :warning: 本研讨会假定您熟悉基本的Python和Jupyter笔记本。 如果您从未使用过Python，我有一个单独的Python入门讲习班。 如果您需要Python更新器和/或Jupyter简介，建议您使用我生产的Jupyter和Python更新器。