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qupath-extension-tunel:QuPath扩展用于主动学习
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2021-05-08
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主动学习扩展 QuPath扩展包括主动学习原子核和细胞分类。 介绍 此扩展包括针对生物学显微镜图像中分类问题的通用主动学习方法。 这种方法的一个优点是它可以在荧光和显微镜图像上工作。 该方法比使用标准QuPath版本的机器学习功能快得多,因为要获得相同的性能,必须注释的样本要少得多。 安装 该扩展的安装过程与其他QuPath扩展的安装过程完全相同。 用户应将.jar文件拖到QuPath主窗口上,或将其直接放在扩展文件夹中。 该项目的源代码可从“ ”获得。 可以从这些项目文件中编译jar文件。 在以下位置有两个预编译的jar文件(均为必需): : 使用扩展名 分割 在分类之前,用户应使用他们经常使用的技术进行细分。 这可以是QuPath中的分水岭分割,也可以是通过ImageJ扩展使用的任何分割方法。 分类 主动学习扩展使用标准QuPath版本中的标准机器学习分类器执行分类。 这样做是
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qupath-extension-tunel-master.zip (94个子文件)
qupath-extension-tunel-master
.gitignore 9B
images
Classsifier.PNG 32KB
Panel.PNG 18KB
Sampling.PNG 70KB
src
main
resources
META-INF
services
qupath.lib.gui.extensions.QuPathExtension 36B
scripting_styles.css 482B
licenses
RichTextFX
WellBehavedFX
LICENSE.txt 1KB
UndoFX
LICENSE.txt 1KB
Flowless
LICENSE.txt 1KB
ReactFX
LICENSE.txt 1KB
RichTextFX
LICENSE.txt 1KB
java
qupath
lib
scripting
WatershedCellDetection.java 41KB
CreateParentAnnotation.java 3KB
OpenCVDetection.java 14KB
CreateCellFromAnnotation.java 3KB
WatershedCellDetectionCopy.java 40KB
WatershedCellDetection2.java 40KB
Thresholder.java 3KB
TunelDetectionHelper.java 14KB
ThresholderOpenCV.java 20KB
WatershedNucleusDetection.java 29KB
ThesisExtension.java 3KB
ij_opencv
ImagePlusToMatConverter.java 4KB
MatToImagePlusConverter.java 4KB
visualization
visualization.css 72B
ScatterPlotPanel.java 4KB
DimensionalityReduction.java 747B
TsneDimensionalityReduction.java 1KB
ChartTest.java 4KB
PCADimensionalityReduction.java 1KB
algorithms
WatershedDetectionFRSIJ.java 41KB
FastRadialSymmetry.java 7KB
WatershedDetectionFRS.java 20KB
classification
FeatureSelectionPanel.java 11KB
OpenCvClassifierCommand.java 4KB
ClassifierExampleCommand.java 7KB
PathClassifierPanel.java 5KB
RandomForestClassifier.java 9KB
ClassifierBuilderPanel.java 62KB
classifiers
ParameterizableOpenCvClassifier.java 4KB
DTreesClassifier.java 1KB
RTreesClassifier.java 7KB
SVMClassifier.java 3KB
OpenCvClassifier.java 16KB
BayesClassifier.java 1KB
BoostClassifier.java 4KB
KNearestClassifier.java 2KB
NeuralNetworksClassifier.java 4KB
ConfusionMatrix.java 6KB
RetainedTrainingObjects.java 7KB
ClassifierStatisticsHelper.java 3KB
active_learning
ClusteringSampleProposal.java 2KB
ActiveLearningPanel.java 25KB
AbstractExtractionPanel.java 972B
SortedSampleProposal.java 2KB
AbstractClusterer.java 3KB
active_learning.css 72B
SortedClusteringSampleProposal.java 3KB
ActiveLearningCommand.java 2KB
ActiveLearningPanel2.java 37KB
ActiveLearningPanel3.java 34KB
DBScanClusterer.java 1KB
ActiveLearningCommand3.java 4KB
KMeansClusterer.java 2KB
AbstractSampleProposal.java 1KB
RandomSampleProposal.java 1KB
ClusterableObject.java 1000B
ActiveLearningCommand2.java 3KB
save_detections
SaveDetectionImagesCommand.java 16KB
bin
.gitignore 9B
src
main
resources
META-INF
services
qupath.lib.gui.extensions.QuPathExtension 46B
scripting_styles.css 482B
licenses
RichTextFX
WellBehavedFX
LICENSE.txt 1KB
UndoFX
LICENSE.txt 1KB
Flowless
LICENSE.txt 1KB
ReactFX
LICENSE.txt 1KB
RichTextFX
LICENSE.txt 1KB
java
qupath
lib
scripting
RichScriptEditor.class 6KB
RichScriptEditorExtension.class 2KB
RichScriptEditor$CodeAreaControl.class 7KB
RichScriptEditor$AutoCompletor.class 5KB
.classpath 214B
pom.xml 2KB
.project 801B
pom.xml.versionsBackup 2KB
.classpath 2KB
.settings
org.eclipse.m2e.core.prefs 86B
org.eclipse.core.resources.prefs 150B
org.eclipse.jdt.groovy.core.prefs 55B
org.eclipse.jdt.core.prefs 238B
pom.xml 5KB
README.md 4KB
.project 794B
pom.xml.versionsBackup 2KB
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龙窑溪
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