ReViMS:ReViMS，用于光片/共聚焦显微镜的3D体积渲染工具-开源

从多个部分进行重构和可视化（ReViMS），这是一种开放源代码，用户友好的软件，可自动估计3D多细胞聚集体的体积和其他几个特征（例如，癌症球体，斑马鱼，果蝇）。 ReViMS需要2D二进制掩膜的z堆栈，该二维掩膜是通过使用共聚焦或光片荧光显微镜对通过沿z轴扫描聚集体而获取的荧光图像序列进行分割而获得的。 它提供了许多工具，可用于：（a）分割荧光图像的z堆栈； （b）重建集合体的3D表面并估计几个特征（包括体积）。 ReViMS用MATLAB（美国马萨诸塞州MathWorks公司）编写。 它是一个开源工具，其源代码可从以下位置免费获得：http://sourceforge.net/p/revims要求：MATLAB R2017b和Image Processing Toolbox 10.1或更高版本。