DACO-algorithm:一种新颖的转录因子复合物预测算法。-开源

真核基因的表达是通过分子逻辑电路控制的，该电路结合了许多不同因素的调控信号。 转录因子和其他调节蛋白的复合是关键调节途径中信号整合的一种普遍且高度保守的机制，能够推断受控基因以及所发挥的调节机制。 我们开发了DACO（域感知的内聚性优化），这是一种新颖的算法，结合了蛋白质-蛋白质相互作用网络和域-域相互作用网络与簇质量度量的内聚性。 该度量在蛋白质相互作用的整体水平上局部最大化，而在域水平上使用复杂的连接性约束来解释此类装配中相互作用的排他性和固有组合性。 原始出版物可在http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/30/17/i415上找到。