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psap:用于PSAP分类器的Mierlo,G. van的CLI接口。 使用机器学习预测蛋白质冷凝物的形成(准备中的手稿)
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2021-03-30
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psap 用于PSAP分类器的Mierlo,G. van的CLI接口。 使用机器学习(制备中的手稿)预测蛋白质冷凝物的形成。 免费软件:MIT许可证 入门 1.安装psap 2.火车分类器 psap train - f / path / to / peptide - trainingset . fasta - o / output / directory 经过训练的分类器以json格式保存在输出目录中。 3.预测llps psap predict - m / path / to / model . json - f / path / to / peptid - testset . fasta - o / output / directory 如果未提供模型(-m),则psap将加载存储在/ data / model中的默认分类器。 可选的 注释肽序列并将特征数据帧保存到csv
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psap-master.zip (19个子文件)
psap-master
MANIFEST.in 47B
README.rst 2KB
data
model
UP000005640_9606_llps.json 33.52MB
assets
uniprot_ids.txt 650B
tests
test_psap_cli.py 349B
__init__.py 34B
psap
cli.py 3KB
classifier.py 10KB
matrix.py 12KB
__init__.py 339B
_version.py 18KB
LICENSE 1KB
setup.cfg 146B
requirements.txt 150B
setup.py 1KB
.gitignore 1KB
versioneer.py 69KB
.flake8 30B
.gitattributes 30B
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余木脑袋
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