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higlass-orthologs
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2021-05-08
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HiGlass的基因直系同源物 在HiGlass中显示直系同源氨基酸! 缩小(显示与人类匹配的氨基酸): 放大: 注意:这仅是直系同源音轨的源代码! 您可能还想查看以下存储库: HiGlass查看器: : HiGlass服务器: : HiGlass码头工人: : 安装 npm install higlass-orthologs 资料准备 直系同源数据是通过客户端中的Rest API从Ensembl加载的(示例URL: ://rest.ensembl.org/homology/id/ENSG00000139618?type=orthologues&content-type=application/json&cigar_line=0&target_species=cat&target_species=dog) 。 为了确定各个氨基酸在轨迹中的显示位置,我们需要了解用于创建
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higlass-orthologs-master.zip (34个子文件)
higlass-orthologs-master
.gitignore 94B
.babelrc 103B
package.json 3KB
package-lock.json 589KB
src
index.js 186B
scripts
OrthologsTrack.js 42KB
index.js 75B
EnsemblHelper.js 10KB
index.html 7KB
karma.conf.js 2KB
webpack.config.js 4KB
LICENSE 1KB
.github
workflows
nodejs.yml 832B
npmpublish.yml 1012B
examples
hg38_full.txt 11KB
representative_transcripts_20200909.beddb 8.39MB
representative_transcripts_20200909.txt 5.58MB
scripts
get_representative_transcripts.py 3KB
Ensembl-biomart-settings.png 72KB
extractTranscriptDataFromGTF.py 5KB
commands.txt 652B
representative_transcripts.txt 453KB
chromInfo_hg38.txt 365B
get_relevant_transcripts_DONOTUSE.py 2KB
aggregate_transcripts.py 14KB
README.md 5KB
.vscode
settings.json 45B
test
SVGExportTests.js 1KB
utils
FetchMockHelper.js 5KB
test-helpers.js 2KB
view-configs
simple-track.json 2KB
mocked-responses
OrthologsTest.json 8KB
SVGExport.json 8KB
OrthologsTests.js 3KB
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RosieLau
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