Paired-Tag:配对标签数据集的分析

配对标签/配对seq数据集的预处理 请首先安装以下软件： 领结， bowtie2， //bowtie-bio.sourceforge.net/bowtie2/index.shtml Trim_galore， //www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/trim_galore/ STAR， 可选：FastQC， ：//www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/ 初始质量控制 FastQC软件可以快速进行初始质量控制。 FastQC将提供对从Illumina bcl2fastq程序生成的fastq文件的几个关键质量指标的质量控制摘要。下图显示了具有代表性的成对标签库中FastQC输出文件的“按碱基序列内容”和“适配器浓度”部分。 如Read1报告中所示，第二个碱基中G碱基的比