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Classifier-construction-in-Boolean-Networks-using-algebraic-meth...
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2021-05-21
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示例:表型的分类器 要运行脚本,请使用: python3 groebner.py --bnet n7s3.bnet --phenotype "v4 & !v6" 示例:稳态 要运行脚本,请使用: python3 groebner.py --bnet n7s3.bnet --steady-states bnet格式 .bnet文件和分类器定义的语法为 | 表示析取 &表示连词 ! 表示否定 要求 主要要求是SAGE: 码头工人 建立图片: docker build -t rschwieger . 运行图像: docker run -v $(pwd):/media -it rschwieger
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Classifier-construction-in-Boolean-Networks-using-algebraic-methods-master.zip (19个子文件)
Classifier-construction-in-Boolean-Networks-using-algebraic-methods-master
validation.py 1KB
.gitignore 38B
tex_writer.py 1KB
example4.py 2KB
requirements.txt 20B
candidate_sets.py 4KB
compute_minimal_normal_forms.py 7KB
example2.py 3KB
dockerfile 162B
junk.html 626KB
bnet_parser.py 3KB
README.md 589B
script-for-measuring-time.sh 68B
tests
test_bnet_parser.py 1KB
example_cell_fates.py 3KB
example1.py 2KB
example3.py 3KB
dockerrun 297B
groebner.py 7KB
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